Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nufip1Q9QXX8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nufip1Q9QXX8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nufip1Q9QXX8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nufip1Q9QXX8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nufip1Q9QXX8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nufip1Q9QXX8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nufip1Q9QXX8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nufip1Q9QXX8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nufip1Q9QXX8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nufip1Q9QXX8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nufip1Q9QXX8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nufip1Q9QXX8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nufip1Q9QXX8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms