Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXU7

Prok2, Prokineticin-2, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok2Q9QXU7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prok2Q9QXU7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prok2Q9QXU7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms