Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip4Q9QXN3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip4Q9QXN3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms