Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChmQ9QXG2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms