Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl3Q9JMG7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms