Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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