Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms