Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx6Q9JKK1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms