Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ap4m1Q9JKC7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms