Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r3fQ9JIG4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms