Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcirg1Q9JHF5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcirg1Q9JHF5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms