Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfcp2Q9ERA0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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