Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dap3Q9ER88 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms