Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
V1ra8Q9EQ48 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
V1ra8Q9EQ48 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
V1ra8Q9EQ48 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
V1ra8Q9EQ48 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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V1ra8Q9EQ48 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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V1ra8Q9EQ48 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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V1ra8Q9EQ48 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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V1ra8Q9EQ48 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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V1ra8Q9EQ48 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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V1ra8Q9EQ48 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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V1ra8Q9EQ48 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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V1ra8Q9EQ48 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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V1ra8Q9EQ48 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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V1ra8Q9EQ48 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
V1ra8Q9EQ48 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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