Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SgshQ9EQ08 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms