Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap3s1Q9DCR2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms