Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp27a1Q9DBG1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms