Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms