Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms