Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldnd2Q9D9H2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldnd2Q9D9H2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms