Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot8Q9D8X5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot8Q9D8X5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms