Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms