Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms