Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Cldn22Q9D7U6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Cldn22Q9D7U6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Cldn22Q9D7U6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Cldn22Q9D7U6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Cldn22Q9D7U6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Cldn22Q9D7U6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Cldn22Q9D7U6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Cldn22Q9D7U6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Cldn22Q9D7U6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn22Q9D7U6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn22Q9D7U6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn22Q9D7U6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn22Q9D7U6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn22Q9D7U6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn22Q9D7U6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn22Q9D7U6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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