Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms