Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp4cQ9D7F7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4cQ9D7F7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms