Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H2

Hspb11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb11Q9D6H2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hspb11Q9D6H2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hspb11Q9D6H2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms