Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gins2Q9D600 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gins2Q9D600 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms