Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc39Q9D5Y1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms