Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efhd1Q9D4J1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms