Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms