Protein–RNA interactions for Protein: Q9D413

Sh2d6, SH2 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d6Q9D413 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d6Q9D413 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms