Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms