Protein–RNA interactions for Protein: Q9D180

Cfap57, Cilia- and flagella-associated protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap57Q9D180 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfap57Q9D180 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap57Q9D180 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms