Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdca7Q9D0M2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdca7Q9D0M2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms