Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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