Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mdm1Q9D067 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mdm1Q9D067 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms