Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms