Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms