Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ61

Gm17509, Predicted gene, 17509, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17509Q9CZ61 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm17509Q9CZ61 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17509Q9CZ61 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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