Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ15

Gins1, DNA replication complex GINS protein PSF1, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins1Q9CZ15 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gins1Q9CZ15 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gins1Q9CZ15 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms