Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.6 ms