Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mis12Q9CY25 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms