Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl11Q9CXW4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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