Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prdm5Q9CXE0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms