Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
4930535I16RikQ9CUI2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930535I16RikQ9CUI2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms