Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud1Q9CUB6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms