Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ska2Q9CR46 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ska2Q9CR46 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska2Q9CR46 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms