Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tma16Q9CR02 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms