Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL5

Mrpl18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl18Q9CQL5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl18Q9CQL5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl18Q9CQL5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl18Q9CQL5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms